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Anlässlich des Geburtstages des Piratenkapitäns Störtebeker, welcher der Legende nach in Hamburg hingerichtet worden sein soll, wird der Schädel Störtebekers im Museum ausgestellt und das Teekontor Krogmann veranstaltet eine Feier. Allerdings wird der Schädel aus dem Museum gestohlen.
Während der Feier im Teekontor versteckt der Dieb den Schädel in der Küche der Krogmanns, wo die Polizei ihn auch findet. Die Pfefferkörner müssen nun beweisen, dass Emmas und Sophies Eltern unschuldig sind und den wahren Täter ermitteln.